EMBOSS快速指南文檔
- 軟件類型：
- 國產軟件
- 軟件語言：
- 簡體中文
- 軟件大�。�
- 1 MB
- 軟件授權：
- 免費軟件
- 軟件評級：
- 4
- 更新時間：
- 2017-05-12
- 應用平臺：
- WinXP, Win7, WinAll
EMBOSS快速指南文檔是一個開源的序列分析軟件包，可在UNIX系統(tǒng)上以命令行方式運行，目前也已經有基于X窗口系統(tǒng)和Web的圖形界面的EMBOSS。
軟件功能
該軟件包源于1988年開始開發(fā)的EGCG系統(tǒng)，整合了目前可以獲得的大部分序列分析軟件，并有一套專門設計的C語言庫函數。
軟件特色
程序幫助
尋找一個程序，可以使用EMBOSS 應用程序wossname，用一個關鍵字對所有程序的描述
進行搜索。
wossname keyword 顯示在描述信息中包含該關鍵字的所有程序列表
wossname -alphabetic –auto 顯示所有程序
programname –help 給出該程序的可用參數
tfm programname 顯示該程序的文檔。
序列格式
序列儲存在數據庫內或是以純文本存于文件內。EMBOSS不支持Word處理的文件！缺省
的序列格式是fasta。這個格式的第一行是初始標題行包含一個“>”，其后是序列描述的，
第二行及以后的行是序列，例如：
>fau Human FAU gene fragment
GACCGGCCAGGAAACGGCATG
當前的EMBOSS 支持42 種格式，包括Clustal， EMBL， GCG， GenBank， PIR， MSF， Phylip，
SwissProt， Text(raw)。
所以程序的缺省輸出可以通過環(huán)境變量的設置來改變：
setenv EMBOSS_OUTFORMAT format
等用程序
embossdata 找到或取出用EMBOSS程序讀入的數據文件
embossversion 顯示出當前EMBOSS的版本號
本文檔由英國EMBnet節(jié)點的Lisa Mullan設計和撰寫，由EMBnet的P&PR發(fā)布委員會發(fā)
布。
EMBnet－歐洲分子生物學網絡－是一個由眾多歐洲生物信息中心組成的生物信息網絡。大
多數國家都有一個國家節(jié)點，能為生物信息軟件用戶提供培訓課程和其他形式的幫助。
你能從EMBnet站點發(fā)現關于你的國家節(jié)點的信息：
[url]http://www.embnet.org/[/url]
EMBOSS快捷指南。
更新日志
對部分功能進行了優(yōu)化。
軟件截圖
