輕松學用生物軟件是一個多平臺開源軟件，主要目的是協(xié)助缺乏生物信息學經(jīng)驗的分子生物學家管理、分析和可視化他們的數(shù)據(jù)。UGENE在一個常見用戶界面中整合了廣泛使用的生物信息學工具。該工具包支持多種生物學數(shù)據(jù)格式，并允許從遠程數(shù)據(jù)來源檢索數(shù)據(jù)。d7V紅軟基地

軟件功能

它提供了生物學對象（例如帶注釋的基因組序列、下一代測序（Next Generation Sequencing，NGS）裝配數(shù)據(jù)，多重序列比對，系統(tǒng)發(fā)生樹和三維結(jié)構(gòu)）的可視化模塊。大部分整合的算法被調(diào)整以通過使用多線程和專用處理器指令發(fā)揮最大性能。UGENE包括一個可視化環(huán)境以創(chuàng)建能夠在本地資源或在一個高性能計算（High Performance Computing，HPC）環(huán)境中啟動的可重用流程。UGENE使用Qt框架以C++編寫。內(nèi)置的插件系統(tǒng)和結(jié)構(gòu)化UGENE API使得可以用新的功能擴展該工具包。d7V紅軟基地

軟件特色

unipro是一個多平臺開源軟件，其主要目標是幫助分子生物學家在生物信息學中沒有太多的專業(yè)知識來管理、分析和可視化他們的數(shù)據(jù)。ugene集成了廣泛使用的生物信息學工具在一個通用的用戶界面中。該工具包支持多種生物數(shù)據(jù)格式，允許從遠程數(shù)據(jù)源檢索數(shù)據(jù)。它提供了生物對象的可視化模塊，如注釋的基因組序列、新一代測序匯編數(shù)據(jù)。d7V紅軟基地

軟件說明

1、基因芯片綜合分析軟件。 d7V紅軟基地
ArrayVision 7.0 一種功能強大的商業(yè)版基因芯片分析軟件，不僅可以進行圖像分析，還可以進行數(shù)據(jù)處理，方便protocol的管理功能強大，商業(yè)版正式版：6900美元。 d7V紅軟基地
Arraypro 4.0 Media Cybernetics公司的產(chǎn)品，該公司的gelpro， imagepro一直以精確成為同類產(chǎn)品中的佼佼者，相信arraypro也不會差。 d7V紅軟基地
phoretix™ Array Nonlinear Dynamics公司的基因片綜合分析軟件。 d7V紅軟基地
J-express 挪威Bergen大學編寫，是一個用JAVA語言寫的應用程序，界面清晰漂亮，用來分析微矩陣（microarray）實驗獲得的基因表達數(shù)據(jù)，需要下載安裝JAVA運行環(huán)境JRE1.2后(5.1M)后，才能運行。d7V紅軟基地
2、 基因芯片閱讀圖像分析軟件d7V紅軟基地
ScanAlyze 2.44 ，斯坦福的基因芯片基因芯片閱讀軟件，進行微矩陣熒光圖像分析，包括半自動定義格柵與像素點分析。輸出為分隔的文本格式，可很容易地轉(zhuǎn)化為任何數(shù)據(jù)庫。d7V紅軟基地
3、 基因芯片數(shù)據(jù)分析軟件d7V紅軟基地
Cluster 斯坦福的對大量微矩陣數(shù)據(jù)組進行各種簇（Cluster）分析與其它各種處理的軟件。 d7V紅軟基地
SAM Significance Analysis of Microarrays 的縮寫，微矩陣顯著性分析軟件，EXCEL軟件的插件，由Stanford大學編制。d7V紅軟基地
4．基因芯片聚類圖形顯示 d7V紅軟基地
TreeView 1.5 斯坦福開發(fā)的用來顯示Cluster軟件分析的圖形化結(jié)果�，F(xiàn)已和Cluster成為了基因芯片處理的標準軟件。 d7V紅軟基地
Freeview 是基于JAVA語言的系統(tǒng)樹生成軟件，接收Cluster生成的數(shù)據(jù)，比Treeview增強了某些功能。d7V紅軟基地
5．基因芯片引物設計d7V紅軟基地
Array Designer 2.00 DNA微矩陣（microarray）軟件，批量設計DNA和寡核苷酸引物工具。d7V紅軟基地

軟件截圖

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