MOIL(免費分子模型建模軟件)，免費三維分子模型建模軟件。Quy紅軟基地

軟件介紹

MOIL(免費分子模型建模軟件)是一款功能強大的，易于使用的 FBLD（Fragment Based Lead Discovery 基于分子片段的藥物研究）與 SBDD（structure-baseddrugdesign，基于結(jié)構(gòu)的藥物設計）平臺。Quy紅軟基地

軟件功能

1、能量最小計算：能量最小化計算考察分子的穩(wěn)定結(jié)構(gòu)，或通過軟件提供的MOPAC、Jaguar， GANESS及Gaussian的接口，進行從頭計算或半經(jīng)驗計算，甚至NMR，IR或Raman光譜的預測，其中MM2-對分子進行初步的能量最小化計算，MOPAC-半經(jīng)驗算法， MMFF94-12.0版本新增加力場，而GAMESS、 Jaguar好Gaussian-從頭計算。Quy紅軟基地
2、ChemBio3D能夠計算分子更多的物化性質(zhì)，以平面進行旋轉(zhuǎn)，計算能量最小構(gòu)造，以下圖為例，圖A是最低能量構(gòu)造側(cè)視圖，圖B是最低能量構(gòu)造俯視圖，圖C是分子所在兩個平面的夾角對能量的影響。Quy紅軟基地
三種能量最小構(gòu)造Quy紅軟基地
3、物化性質(zhì)計算：ChemBio3D可計算分子更多的物化性質(zhì)。ChemProp Pro包括固有變量計算，如沸點、臨界壓力、溫度和體積、亨利定律常數(shù)、熔點、蒸汽壓和水溶性等。ChemPro Std包括形式電荷、幾個Connolly變量、準確質(zhì)量、橢圓度等。CLogP Driver能夠計算提供摩爾折射率和分配系數(shù)，支持GAMESS程序接口、Jaguar程序接口、MOPAC程序接口。另外，Molecular Topology可用于測量分子拓撲學的諸多方面，包括Balaban指數(shù)、Cluster Count、一些旋轉(zhuǎn)鍵、形狀系數(shù)、拓撲直徑和其它參數(shù)等。Quy紅軟基地

軟件特色

　　1、該分子模型軟件支持生成分子坐標（PDB格式）； Quy紅軟基地
　　2、支持設定電子密度； Quy紅軟基地
　　2、支持MSMS表面數(shù)據(jù)； Quy紅軟基地
　　3、支持apbs靜電勢圖。Quy紅軟基地

軟件截圖

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