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RNA結構分析(FlexNovo)是模擬配體預測和停靠的活動站點上下文中的大片段FlexNovo 是一個簡單和容易使用的命令行實用工具,它使您能夠輕松地分析結構圖案和蛋白的 RNA。FlexNovo 基于 FlexX 技術,是一種分子的RNA結構分析實用程序,使您能夠查看的片段,演變以及化學配體的理化和幾何屬性。
它使您能夠輕松地分析結構圖案和蛋白的 RNA。FlexNovo 基于 FlexX 技術,是一種分子的RNA結構分析實用程序,使您能夠查看的片段,演變以及化學配體的理化和幾何屬性。
1、原始數(shù)據(jù)產出統(tǒng)計
2、過濾掉低質量reads后的數(shù)據(jù)統(tǒng)計
3、高級生物信息分析結果報告。
RNA結構分析(FlexNovo)是利用Trinity (Version: r2011-08-20) 進行de novo assembly, Trinity參數(shù):--min_kmer_cov 2 -- min_contig_length 100 --run_butterfly。拼接后的轉錄本,通過PERL腳本去冗余,在同一個component ID的序列中選擇最長的一個isoform代表該locus的轉錄本,得到Unigene集。